MBR突出的特征是占地面積小，耐沖擊負荷，出水水質(zhì)優(yōu)良，自動化程度高容易管理，但MBR工藝現(xiàn)在仍然存在的某些問題。

1 處理能力降低的風險

MBR通常在恒定通量下進行，為了持續(xù)運行要求MBR不能超過極限通量,超過這個極限會產(chǎn)生膜污染，那么多余的水就無法通過膜孔徑，產(chǎn)水率下降。很多MBR工藝在實際運行過程中隨著時間的積累，其處理能力不斷下降，很多水廠的處理能力甚至不足設(shè)計之初的50%。美國環(huán)保局認為，如果MBR工藝的進水峰值流量超過平均流量的1.5~2倍，就需設(shè)置流量調(diào)節(jié)池，或者備有大量的膜組件以保證出水水質(zhì)達標。

2 投資成本與運行成本較高

如今，膜組件是MBR處理系統(tǒng)中主要組成部分，同時也是技術(shù)含量最高及價值最大的部分,其成本占據(jù)整體設(shè)備投入的多部分。此外，MBR需要先進的設(shè)備以滿足其自動化的要求，這也增加了其成本。浸沒式MBR工藝，需加大曝氣強度，造成能耗上升。另外，膜組件壽命有限，達到一定使用年先后需更換膜組件。據(jù)分析，國內(nèi)MBR投資成本在2000~2500元/m3，是傳統(tǒng)活性污泥法項目建設(shè)成本的1. 5倍左右。

3 預處理與自控系統(tǒng)設(shè)計不足而產(chǎn)生的風險

通常MBR工藝需先經(jīng)過預處理再進入膜處理反應(yīng)器內(nèi)。預處理不到位或者不經(jīng)預處理便進入膜反應(yīng)器內(nèi)必會產(chǎn)生嚴重的后果。MBR工藝自動化程度比傳統(tǒng)活性污泥工藝高很多，膜組件需定期清洗、組裝甚至是更換，為保證出水水質(zhì)，對水廠PLC控制系統(tǒng)有較高要求。